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BTK::CHARMM Namespace Reference


Enumerations

enum  index_t {
  UNKNOWN = -1, H, HC, HA,
  HT, HP, HB, HR1,
  HR2, HR3, HS, HE1,
  HE2, C, CA, CT1,
  CT2, CT3, CPH1, CPH2,
  CPT, CY, CP1, CP2,
  CP3, CC, CD, CPA,
  CPB, CPM, CM, CS,
  CE1, CE2, N, NR1,
  NR2, NR3, NH1, NH2,
  NH3, NC2, NY, NP,
  NPH, O, OB, OC,
  OH1, OS, OT, OM,
  S, SM, SS, HE,
  NE, CAL, ZN, FE,
  DUM, HN1, HN2, HN3,
  HN3B, HN3C, HNP, HN4,
  HN5, HN6, HN7, HN8,
  HN9, HNE1, HNE2, CN1,
  CN1A, CN1T, CN2, CN3,
  CN3A, CN3B, CN3C, CN3D,
  CN3T, CN4, CN5, CN5G,
  CN7, CN7B, CN7C, CN7D,
  CN8, CN8B, CN9, CNE1,
  CNE2, CNA, CNA2, NN1,
  NN1C, NN2, NN2B, NN2C,
  NN2U, NN2G, NN3, NN3A,
  NN3I, NN3G, NN4, NN5,
  NN6, ON1, ON1C, ON2,
  ON3, ON4, ON5, ON6,
  ON6B, ON2b, FN1, FNA,
  P, P2, SOD, MG,
  POT, CES, CLA, SIZE
}

Functions

index_t btk_atom_index_to_charmm_index (GROUP::index_t g, ATOM::index_t a)


Enumeration Type Documentation

enum BTK::CHARMM::index_t
 

Enumeration values:
UNKNOWN 
H 
HC 
HA 
HT 
HP 
HB 
HR1 
HR2 
HR3 
HS 
HE1 
HE2 
C 
CA 
CT1 
CT2 
CT3 
CPH1 
CPH2 
CPT 
CY 
CP1 
CP2 
CP3 
CC 
CD 
CPA 
CPB 
CPM 
CM 
CS 
CE1 
CE2 
N 
NR1 
NR2 
NR3 
NH1 
NH2 
NH3 
NC2 
NY 
NP 
NPH 
O 
OB 
OC 
OH1 
OS 
OT 
OM 
S 
SM 
SS 
HE 
NE 
CAL 
ZN 
FE 
DUM 
HN1 
HN2 
HN3 
HN3B 
HN3C 
HNP 
HN4 
HN5 
HN6 
HN7 
HN8 
HN9 
HNE1 
HNE2 
CN1 
CN1A 
CN1T 
CN2 
CN3 
CN3A 
CN3B 
CN3C 
CN3D 
CN3T 
CN4 
CN5 
CN5G 
CN7 
CN7B 
CN7C 
CN7D 
CN8 
CN8B 
CN9 
CNE1 
CNE2 
CNA 
CNA2 
NN1 
NN1C 
NN2 
NN2B 
NN2C 
NN2U 
NN2G 
NN3 
NN3A 
NN3I 
NN3G 
NN4 
NN5 
NN6 
ON1 
ON1C 
ON2 
ON3 
ON4 
ON5 
ON6 
ON6B 
ON2b 
FN1 
FNA 
P 
P2 
SOD 
MG 
POT 
CES 
CLA 
SIZE 


Function Documentation

index_t btk_atom_index_to_charmm_index GROUP::index_t  g,
ATOM::index_t  a
 


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