Main Page | Modules | Namespace List | Class Hierarchy | Alphabetical List | Class List | File List | Namespace Members | Class Members | File Members

BTK::ATOM Namespace Reference


Enumerations

enum  index_t {
  UNKNOWN = -1, _1C2x, _1C3x, _1CB,
  _1H2xx, _1H3x, _1H3xx, _1O2x,
  _1SG, _2C5x, _2CB, _2H5x,
  _2H5xx, _2O1P, _2O2P, _2O5x,
  _2P, _2SG, AC1x, AC2,
  AC2x, AC3x, AC4, AC4x,
  AC5, AC5x, AC6, AC8,
  AH1x, AH2, AH2x, AH2T,
  AH3x, AH3T, AH4x, AH5x,
  AH5s, AH61, AH62, AH8,
  AN1, AN3, AN6, AN7,
  AN9, AO1, AO1P, AO2,
  AO2x, AO2P, AO2T, AO3x,
  AO4x, AO5x, AP, AP2,
  C, C1, C1x, C10,
  C12, C1A, C1B, C1C,
  C1D, C2, C2x, C2A,
  C2B, C2C, C2D, C3,
  C3x, C3A, C3B, C3C,
  C3D, C3T, C4, C4x,
  C4A, C4B, C4C, C4D,
  C5, C5x, C5M, C5T,
  C6, C7, C8, C9,
  C9B, CA, CAA, CAB,
  CAC, CAD, CAL, CAT,
  CAY, CB, CBA, CBB,
  CBC, CBD, CD, CD1,
  CD2, CE, CE1, CE2,
  CE3, CES, CG, CG1,
  CG2, CGA, CGD, CH2,
  CHA, CHB, CHC, CHD,
  CLA, CMA, CMB, CMC,
  CMD, CT, CY, CZ,
  CZ2, CZ3, DUM, F2x,
  FE, H1, H1x, H1xx,
  H11, H11x, H12, H12x,
  H13, H15, H16, H17,
  H2, H2x, H2xx, H21,
  H21x, H22, H22x, H23,
  H3, H3x, H3xx, H31x,
  H32x, H3T, H3T1, H3T2,
  H3T3, H4, H4x, H4xx,
  H41, H41x, H42, H42x,
  H5, H5x, H5xx, H51,
  H51x, H52, H52x, H53,
  H53x, H5M1, H5M2, H5M3,
  H5T, H5T1, H5T2, H5T3,
  H6, H61, H62, H8,
  H9, H91, H92, H93,
  H9B1, H9B2, H9B3, HA,
  HA1, HA2, HAA1, HAA2,
  HAB, HAC, HAD1, HAD2,
  HB, HB1, HB2, HB3,
  HBA1, HBA2, HBB1, HBB2,
  HBC1, HBC2, HBD1, HBD2,
  HC, HD, HD1, HD11,
  HD12, HD13, HD2, HD21,
  HD22, HD23, HD3, HE,
  HE1, HE2, HE21, HE22,
  HE3, HG, HG1, HG11,
  HG12, HG13, HG2, HG21,
  HG22, HG23, HH, HH11,
  HH12, HH2, HH21, HH22,
  HMA1, HMA2, HMA3, HMB1,
  HMB2, HMB3, HMC1, HMC2,
  HMC3, HMD1, HMD2, HMD3,
  HN, HN1, HN2, HNT,
  HT1, HT2, HT3, HY1,
  HY2, HY3, HZ, HZ1,
  HZ2, HZ3, MG, N,
  N1, N14, N2, N3,
  N4, N6, N7, N9,
  NA, NB, NC, NC1x,
  NC2, NC2x, NC3, NC3x,
  NC4, NC4x, NC5, NC5x,
  NC6, NC7, ND, ND1,
  ND2, NE, NE1, NE2,
  NH1, NH1x, NH2, NH2x,
  NH2T, NH3x, NH3T, NH4,
  NH4x, NH42, NH5, NH5x,
  NH5s, NH6, NH71, NH72,
  NN1, NN7, NO1, NO2,
  NO2x, NO3x, NO4x, NO5x,
  NO7, NP, NT, NZ,
  O, O1, O11, O12,
  O13, O14, O1A, O1B,
  O1D, O1G, O1P, O1P3,
  O2, O2x, O21, O22,
  O23, O24, O2A, O2B,
  O2D, O2G, O2P, O2P3,
  O3, O3x, O31P, O32P,
  O33P, O3A, O3B, O3G,
  O3P, O3P3, O3T, O4,
  O4x, O5x, O5T, O6,
  OD1, OD2, OE1, OE2,
  OG, OG1, OH, OH2,
  OT1, OT2, OY, P,
  P1, P2, P3, PA,
  PB, PG, POT, SD,
  SG, SOD, ZN, SIZE
}

Functions

index_t pdbname_to_atom_index (const std::string &s)
const std::string & atom_index_to_pdbname (index_t i)
ELEMENT::index_t atom_index_to_element_index (index_t i)


Enumeration Type Documentation

enum BTK::ATOM::index_t
 

Enumeration values:
UNKNOWN 
_1C2x 
_1C3x 
_1CB 
_1H2xx 
_1H3x 
_1H3xx 
_1O2x 
_1SG 
_2C5x 
_2CB 
_2H5x 
_2H5xx 
_2O1P 
_2O2P 
_2O5x 
_2P 
_2SG 
AC1x 
AC2 
AC2x 
AC3x 
AC4 
AC4x 
AC5 
AC5x 
AC6 
AC8 
AH1x 
AH2 
AH2x 
AH2T 
AH3x 
AH3T 
AH4x 
AH5x 
AH5s 
AH61 
AH62 
AH8 
AN1 
AN3 
AN6 
AN7 
AN9 
AO1 
AO1P 
AO2 
AO2x 
AO2P 
AO2T 
AO3x 
AO4x 
AO5x 
AP 
AP2 
C 
C1 
C1x 
C10 
C12 
C1A 
C1B 
C1C 
C1D 
C2 
C2x 
C2A 
C2B 
C2C 
C2D 
C3 
C3x 
C3A 
C3B 
C3C 
C3D 
C3T 
C4 
C4x 
C4A 
C4B 
C4C 
C4D 
C5 
C5x 
C5M 
C5T 
C6 
C7 
C8 
C9 
C9B 
CA 
CAA 
CAB 
CAC 
CAD 
CAL 
CAT 
CAY 
CB 
CBA 
CBB 
CBC 
CBD 
CD 
CD1 
CD2 
CE 
CE1 
CE2 
CE3 
CES 
CG 
CG1 
CG2 
CGA 
CGD 
CH2 
CHA 
CHB 
CHC 
CHD 
CLA 
CMA 
CMB 
CMC 
CMD 
CT 
CY 
CZ 
CZ2 
CZ3 
DUM 
F2x 
FE 
H1 
H1x 
H1xx 
H11 
H11x 
H12 
H12x 
H13 
H15 
H16 
H17 
H2 
H2x 
H2xx 
H21 
H21x 
H22 
H22x 
H23 
H3 
H3x 
H3xx 
H31x 
H32x 
H3T 
H3T1 
H3T2 
H3T3 
H4 
H4x 
H4xx 
H41 
H41x 
H42 
H42x 
H5 
H5x 
H5xx 
H51 
H51x 
H52 
H52x 
H53 
H53x 
H5M1 
H5M2 
H5M3 
H5T 
H5T1 
H5T2 
H5T3 
H6 
H61 
H62 
H8 
H9 
H91 
H92 
H93 
H9B1 
H9B2 
H9B3 
HA 
HA1 
HA2 
HAA1 
HAA2 
HAB 
HAC 
HAD1 
HAD2 
HB 
HB1 
HB2 
HB3 
HBA1 
HBA2 
HBB1 
HBB2 
HBC1 
HBC2 
HBD1 
HBD2 
HC 
HD 
HD1 
HD11 
HD12 
HD13 
HD2 
HD21 
HD22 
HD23 
HD3 
HE 
HE1 
HE2 
HE21 
HE22 
HE3 
HG 
HG1 
HG11 
HG12 
HG13 
HG2 
HG21 
HG22 
HG23 
HH 
HH11 
HH12 
HH2 
HH21 
HH22 
HMA1 
HMA2 
HMA3 
HMB1 
HMB2 
HMB3 
HMC1 
HMC2 
HMC3 
HMD1 
HMD2 
HMD3 
HN 
HN1 
HN2 
HNT 
HT1 
HT2 
HT3 
HY1 
HY2 
HY3 
HZ 
HZ1 
HZ2 
HZ3 
MG 
N 
N1 
N14 
N2 
N3 
N4 
N6 
N7 
N9 
NA 
NB 
NC 
NC1x 
NC2 
NC2x 
NC3 
NC3x 
NC4 
NC4x 
NC5 
NC5x 
NC6 
NC7 
ND 
ND1 
ND2 
NE 
NE1 
NE2 
NH1 
NH1x 
NH2 
NH2x 
NH2T 
NH3x 
NH3T 
NH4 
NH4x 
NH42 
NH5 
NH5x 
NH5s 
NH6 
NH71 
NH72 
NN1 
NN7 
NO1 
NO2 
NO2x 
NO3x 
NO4x 
NO5x 
NO7 
NP 
NT 
NZ 
O 
O1 
O11 
O12 
O13 
O14 
O1A 
O1B 
O1D 
O1G 
O1P 
O1P3 
O2 
O2x 
O21 
O22 
O23 
O24 
O2A 
O2B 
O2D 
O2G 
O2P 
O2P3 
O3 
O3x 
O31P 
O32P 
O33P 
O3A 
O3B 
O3G 
O3P 
O3P3 
O3T 
O4 
O4x 
O5x 
O5T 
O6 
OD1 
OD2 
OE1 
OE2 
OG 
OG1 
OH 
OH2 
OT1 
OT2 
OY 
P 
P1 
P2 
P3 
PA 
PB 
PG 
POT 
SD 
SG 
SOD 
ZN 
SIZE 


Function Documentation

ELEMENT::index_t BTK::ATOM::atom_index_to_element_index index_t  i  ) 
 

Here is the call graph for this function:

const std::string & BTK::ATOM::atom_index_to_pdbname index_t  i  ) 
 

Here is the call graph for this function:

ATOM::index_t BTK::ATOM::pdbname_to_atom_index const std::string &  s  ) 
 

Here is the call graph for this function:


Generated on Wed Apr 14 00:43:28 2004 for BTK by doxygen 1.3.6