• atom_to_element() : atom_types.cpp
• get_d2() : sasa_atom_algorithms.cpp
• get_index() : sasa_atom_algorithms.cpp
• get_polar_bin() : sasa_atom_algorithms.cpp
• groupatom_to_charmm() : charmm_types.cpp
• index_to_name1_map() : group_types.cpp
• index_to_name3_map() : group_types.cpp
• init_static() : atom_types.cpp
• name3_to_index_map() : group_types.cpp
• off_diagonal() : linear_algebra.cpp
• operator<<() : polymer.hpp, polymer.h, molecule.hpp, molecule.h
• pdbname_to_atom() : atom_types.cpp
• schur() : linear_algebra.cpp
• set_identity() : linear_algebra.cpp

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